La raison d'être de la Bourgogne Base Fauna (BBF) est de faire connaître la biodiversité pour mieux la préserver, aussi elle s'inscrit dans le projet plus global de l'Observatoire Régional de la Biodiversité. La première fonction avant toute autre est de constituer une banque de données d'alerte régionale sur la faune : c'est la Bourgogne Base Fauna « niveau d'alerte ». Il s'agit de mobiliser et de mutualiser le plus efficacement possible les données des différents acteurs naturalistes de façon à les rendre accessibles facilement et de permettre une veille écologique régionale. La BBF a une vocation d'intérêt général par la mise à disposition de données naturalistes à des structures très diverses, ou des particuliers, et ceci pour des besoins variés (évaluation des politiques environnementales, outils d'aide à la décision, alerte environnementale en cas de projet d'aménagement, information et sensibilisation du public, recherche, information?).

L'utilisation des données de la BBF niveau d'alerte est libre sous réserve d'acceptation des trois grands principes généraux de la charte d'échange des données naturalistes (LIEN vers Charte complète) : la vocation de protection de la biodiversité des données de la BBF, le respect du droit de propriété intellectuelle des données, et l'utilisation des données à des fins non commerciales.

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